MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 69179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212701
2	NC_004342	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
3	NC_004342	A	7	7	291	297	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
4	NC_004342	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
5	NC_004342	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212701
6	NC_004342	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212701
7	NC_004342	TA	4	8	655	662	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
8	NC_004342	GTAGGA	2	12	672	683	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	24212701
9	NC_004342	A	6	6	723	728	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
10	NC_004342	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	24212701
11	NC_004342	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
12	NC_004342	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	24212701
13	NC_004342	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212701
14	NC_004342	TC	3	6	872	877	0 %	50 %	0 %	50 %	24212701
15	NC_004342	A	6	6	889	894	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
16	NC_004342	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
17	NC_004342	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
18	NC_004342	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212701
19	NC_004342	AT	3	6	1114	1119	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
20	NC_004342	T	6	6	1124	1129	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
21	NC_004342	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
22	NC_004342	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
23	NC_004342	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
24	NC_004342	A	6	6	1194	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
25	NC_004342	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
26	NC_004342	T	7	7	1213	1219	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
27	NC_004342	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
28	NC_004342	A	6	6	1247	1252	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
29	NC_004342	A	8	8	1266	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	24212701
30	NC_004342	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	24212701
31	NC_004342	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	24212701
32	NC_004342	AT	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	24212701
33	NC_004342	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	24212701
34	NC_004342	AC	3	6	1457	1462	50 %	0 %	0 %	50 %	24212701
35	NC_004342	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
36	NC_004342	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212701
37	NC_004342	T	6	6	1523	1528	0 %	100 %	0 %	0 %	24212701
38	NC_004342	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212702
39	NC_004342	AG	3	6	3290	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	24212702
40	NC_004342	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
41	NC_004342	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
42	NC_004342	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	24212702
43	NC_004342	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212702
44	NC_004342	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
45	NC_004342	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
46	NC_004342	T	6	6	3449	3454	0 %	100 %	0 %	0 %	24212702
47	NC_004342	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
48	NC_004342	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
49	NC_004342	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212702
50	NC_004342	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
51	NC_004342	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
52	NC_004342	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
53	NC_004342	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212702
54	NC_004342	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
55	NC_004342	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	24212702
56	NC_004342	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
57	NC_004342	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
58	NC_004342	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
59	NC_004342	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	24212702
60	NC_004342	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
61	NC_004342	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
62	NC_004342	AATTTA	2	12	4106	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	24212702
63	NC_004342	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212702
64	NC_004342	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	24212702
65	NC_004342	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
66	NC_004342	T	8	8	5080	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	24212703
67	NC_004342	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
68	NC_004342	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
69	NC_004342	AAAATT	2	12	5288	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212703
70	NC_004342	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
71	NC_004342	A	8	8	5315	5322	100 %	0 %	0 %	0 %	24212703
72	NC_004342	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
73	NC_004342	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212703
74	NC_004342	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
75	NC_004342	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
76	NC_004342	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212703
77	NC_004342	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212703
78	NC_004342	A	7	7	5547	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	24212703
79	NC_004342	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212703
80	NC_004342	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
81	NC_004342	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212703
82	NC_004342	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212703
83	NC_004342	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
84	NC_004342	A	6	6	5833	5838	100 %	0 %	0 %	0 %	24212703
85	NC_004342	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
86	NC_004342	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
87	NC_004342	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
88	NC_004342	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
89	NC_004342	T	7	7	5993	5999	0 %	100 %	0 %	0 %	24212703
90	NC_004342	ACG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212703
91	NC_004342	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212704
92	NC_004342	A	6	6	6192	6197	100 %	0 %	0 %	0 %	24212704
93	NC_004342	GAAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	25 %	0 %	24212704
94	NC_004342	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212704
95	NC_004342	T	7	7	6333	6339	0 %	100 %	0 %	0 %	24212704
96	NC_004342	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212704
97	NC_004342	TCGT	2	8	6387	6394	0 %	50 %	25 %	25 %	24212704
98	NC_004342	CTT	2	6	6426	6431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212704
99	NC_004342	A	8	8	6459	6466	100 %	0 %	0 %	0 %	24212704
100	NC_004342	A	6	6	6527	6532	100 %	0 %	0 %	0 %	24212704
101	NC_004342	TTC	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212704
102	NC_004342	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
103	NC_004342	A	7	7	6887	6893	100 %	0 %	0 %	0 %	24212705
104	NC_004342	GTT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212705
105	NC_004342	GGT	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
106	NC_004342	ATG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212705
107	NC_004342	TGGGGT	2	12	6979	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
108	NC_004342	GAAGTT	2	12	7022	7033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212705
109	NC_004342	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
110	NC_004342	TTC	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
111	NC_004342	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24212705
112	NC_004342	TTCT	2	8	7185	7192	0 %	75 %	0 %	25 %	24212705
113	NC_004342	T	6	6	7213	7218	0 %	100 %	0 %	0 %	24212705
114	NC_004342	GGTTT	2	10	7226	7235	0 %	60 %	40 %	0 %	24212705
115	NC_004342	GGAAA	2	10	7259	7268	60 %	0 %	40 %	0 %	24212705
116	NC_004342	ACGAA	2	10	7276	7285	60 %	0 %	20 %	20 %	24212705
117	NC_004342	TTTC	2	8	7308	7315	0 %	75 %	0 %	25 %	24212705
118	NC_004342	AAAC	2	8	7333	7340	75 %	0 %	0 %	25 %	24212705
119	NC_004342	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212705
120	NC_004342	ACAA	2	8	7445	7452	75 %	0 %	0 %	25 %	24212705
121	NC_004342	A	6	6	7528	7533	100 %	0 %	0 %	0 %	24212705
122	NC_004342	A	6	6	7550	7555	100 %	0 %	0 %	0 %	24212705
123	NC_004342	AAG	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
124	NC_004342	CCTCAA	2	12	7622	7633	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	24212705
125	NC_004342	T	6	6	7718	7723	0 %	100 %	0 %	0 %	24212705
126	NC_004342	A	6	6	7744	7749	100 %	0 %	0 %	0 %	24212705
127	NC_004342	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
128	NC_004342	GGT	3	9	7838	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
129	NC_004342	GGT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
130	NC_004342	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
131	NC_004342	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
132	NC_004342	ATTATG	2	12	8117	8128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	24212705
133	NC_004342	CTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
134	NC_004342	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	24212705
135	NC_004342	CCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212705
136	NC_004342	TTAA	2	8	8246	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	24212705
137	NC_004342	AAGGAA	2	12	8288	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
138	NC_004342	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212705
139	NC_004342	A	6	6	8308	8313	100 %	0 %	0 %	0 %	24212705
140	NC_004342	AGTTA	2	10	8422	8431	40 %	40 %	20 %	0 %	24212705
141	NC_004342	AGA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
142	NC_004342	AAG	2	6	8688	8693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
143	NC_004342	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
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161	NC_004342	A	6	6	9440	9445	100 %	0 %	0 %	0 %	24212706
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163	NC_004342	A	6	6	9554	9559	100 %	0 %	0 %	0 %	24212706
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171	NC_004342	AGA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
172	NC_004342	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
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272	NC_004342	GGATC	2	10	15268	15277	20 %	20 %	40 %	20 %	24212711
273	NC_004342	ACA	2	6	15319	15324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212711
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305	NC_004342	AT	3	6	16998	17003	50 %	50 %	0 %	0 %	294827556
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398	NC_004342	A	8	8	22100	22107	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
399	NC_004342	A	6	6	22111	22116	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
400	NC_004342	A	6	6	22149	22154	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
401	NC_004342	A	6	6	22206	22211	100 %	0 %	0 %	0 %	24212719
402	NC_004342	ACA	2	6	22272	22277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212719
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